巨集基因組和巨集病毒組的區別是什麼?

時間 2025-07-11 20:45:19

1樓:邢簧粕捎

巨集基因告顫組。

是研究所有微生物,病毒佔比很少,在巨集基因組中研究病毒組就像是大海撈針。巨集病毒組的方法就像是用吸鐵石。

把巨集基因組中病毒組部分吸出來,只看病毒就能避免宿主、細菌序列的影響。另外,巨集病毒組分析流程和巨集基因組有很大區別。

病毒巨集基因組測序又稱巨集病毒組,是在巨集基因組學理論的基礎上,結合現有的病毒分子生物學。

檢測技術而興起的乙個新的學科分支。 巨集病毒組直接以環境中襪孫敗所有病毒的遺傳物質為研究物件,鑑定環境中的病毒組成, 是一種發現新病毒、 病毒感染。

預警和控制的手段, 在病毒的起源和進化模式、遺傳多樣性和地理分佈等研究方面也具有重要意義。

巨集病毒組技術與巨集基因組有什麼不同嗎?

2樓:配飾才

用巨集基因組來研究病毒是前幾年用的比較多的方法,但是缺點很明顯,巨集基因組資料95%以上為宿主基因組汙染,而細菌基因組dna含量是病毒dna的15倍左右,因此在剩下的不足5%,甚至通常不到1%的資料中,病毒dna的reads比例也非常低,造成檢測到的病毒dna遠低於樣品中實際的病毒水平。由此可纖輪見,通過巨集基因組的資料對病毒進行研究,會造成對病毒組認識的偏差。因而,去除宿主和細菌dna後,單獨對病毒組進行研究非常有必要。

所以利用巨集病毒組的方法來研究病毒的優勢就非常明顯,也越來越受到相關科研團隊的關注。巨集病毒組的特點是隻對樣本中的病毒組序列進行研究,這樣的話就避免掉了宿主以及細菌序列的影響,能夠極大的提高資料的利用率。

然而,病毒組資料分析也面臨如下挑戰:(1)由於病毒非常小、進化速度快且難於培養,因此對病毒的研究相對困難。此外病毒缺乏類似於細菌16s rrna基因序列的系統發育標記,對於環境病毒組的研究變得更為複雜。

要對環境樣本中的所有病毒進行研究,不可避免的會受到樣本中其他物種dna的影響;(2)病毒資料庫不夠豐富,病毒群落的基本結構和功能性研究還比較難。

由於人體各個部分的微環境不同,因此不同部位的病毒組均存在差異。其次,年齡、飲食習慣以及巨集基因組中的其他組分等因素也會影響病毒組的組分構成。利用二代測碧豎碼序技術對病毒組進行研究,不僅可以在健康人群和患病個體中發現新的病毒,也可以研究特定疾病與病毒的關係。

病毒組研究最有意思的發現之一是病毒與微生物組中的其他組分相互作用,尤其是細菌。病毒與細菌之間的相互影響可以增強或減弱抗病毒免疫反應從而控制病毒感染。這種影響是相互的,病毒也可以反過來調控細菌感染。

對於在宿主特定遺傳環境下病毒與其他微生物的相互作用及其對病人健康狀態的影響的研究才剛剛起步,有待進一步深入,但目前的研究結果表明病毒及其他微生物對免疫反應的調節會影響感染的結果。

近兩年,許多科學家越來越多的開始關注病毒組,在實驗技術的改進和資料庫的擴充上有重要的進展。但總體來說,目前病毒組研究的報道要麼是基於人類基因組計劃產出的全基因組測序資料,要麼樣本量有限,還有許多未知的領域有待探索。

「巨集轉錄組」和「巨集基因組 」有什麼區別?

3樓:舟山顏值擔當

「巨集轉錄組」和「巨集基因組 」的區別是:基因組一般指的是dna(某些只含有rna的生物除外),而轉錄組則指的是rna。

基因組,genome,一般的定義是單倍體細胞中的全套染色體為乙個基因組,或是單倍體細胞中的全部基因為乙個基因組。可是基因組測序的結果發現基因編碼序列只佔整個基因組序列的很小一部分。因此,基因組應該指單倍體細胞中包括編碼序列和非編碼序列在內的全部dna分子。

說的更確切些,核基因組是單倍體細胞核內的全部 dna分子;線粒體基因組則是乙個線粒體所包含的全部dna分子;葉綠體基因組則是乙個葉綠體所包含的全部dna分子。

詳細內容:遺傳學名詞》第二版對「基因組」的釋義:

單倍體細胞核、細胞器或病毒粒子所含的全部dna分子或rna分子。

現代遺傳學家認為,基因是dna(脫氧核糖核酸)分子上具有遺傳效應的特定核苷酸序列的總稱,是具有遺傳效應的dna分子片段。基因位於染色體上,並在染色體上呈線性排列。基因不僅可以通過複製把遺傳資訊傳遞給下一代,還可以使遺傳資訊得到表達。

不同人種之間頭髮、膚色、眼睛、鼻子等不同,是基因差異所致。

基因是生命遺傳的基本單位,由30億個鹼基對組成的人類基因組,蘊藏著生命的奧秘。始於1990年的國際人類基因組計劃,被譽為生命科學的「登月」計劃,原計劃於2005年完成。各國所承擔工作比例約為美國54%,英國33%,日本7%,法國,德國,中國1%。

此前,人類基因組「工作框架圖」已於2000年6月完成,科學家發現人類基因數目約為萬個,遠少於原先10萬個基因的估計。

人類基因組是全人類的共同財富。國內外專家普遍認為,基因組序列圖首次在分子層面上為人類提供了乙份生命「說明書」,不僅奠定了人類認識自我的基石,推動了生命與醫學科學的革命性進展,而且為全人類的健康帶來了福音。

轉錄組(transcriptome)廣義上指某一生理條件下,細胞內所有轉錄產物的集合,包括信使rna、核糖體rna、轉運rna及非編碼rna;狹義上指所有mrna的集合。

巨集基因組學的介紹

4樓:手機使用者

巨集基因組學(metagenomics)又叫微生物環境基因組學、元基因組學。它通過直接從環境。

樣品中提取全部微生物的dna,構建巨集基因組文庫,利用基因組學的研究策略研究環境樣品所包含的全部微生物的遺傳組成及其群落功能。它是在微生物基因組學的基礎上發展起來的一種研究微生物多樣性、開發新的生理活性物質(或獲得新基因)的新理念和新方法。其主要含義是:

對特定環境中全部微生物的總dna(也稱巨集基因組,metagenomic)進行轉殖,並通過構建巨集基因組文庫和篩選等手段獲得新的生理活性物質;或者根據rdna資料庫設計引物,通過系統學分析獲得該環境中微生物的遺傳多樣性和分子生態學資訊。

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