瓊脂糖凝膠電泳使用什麼染色?需要注意什麼問題

時間 2021-08-30 10:56:37

1樓:匿名使用者

用瓊脂糖作支援介質。另外,實驗室常用的核酸染色劑是溴化乙錠(eb)。

要注意觀察凝膠時應根據染料不同使用合適的光源和激發波長,如果激發波長不對,條帶則不易觀察,出現條帶模糊的現象。其好處是染色效果好,操作方便,但是穩定性差,具有毒性。

一般的核酸檢測只需要瓊脂糖凝膠電泳就可以;如果需要解析度高的電泳,特別是只有幾個bp的差別應該選擇聚丙烯醯胺凝膠電泳;用普通電泳不合適的巨大dna鏈應該使用脈衝凝膠電泳。

擴充套件資料

瓊脂糖凝膠具有網路結構,物質分子通過時會受到阻力,大分子物質在湧動時受到的阻力大,因此在凝膠電泳中,帶電顆粒的分離不僅取決於淨電荷的性質和數量,而且還取決於分子大小,這就大大提高了分辨能力。

但由於其孔徑相比於蛋白質太大,對大多數蛋白質來說其分子篩效應微不足道,現廣泛應用於核酸的研究中。

2樓:

主要使用eb進行染色。但是eb劇毒,注意不要直接用手接觸,染色時候應該做好防護。

3樓:匡雅霜

瓊脂糖凝膠電泳的染料有許多種,近幾年較常用的有:

eb-溴乙錠,eb有較大毒性,可致癌,所以使用時一定要萬分小心。eb染色的背景較強。

sybr green--也叫螢光綠如藍,低毒性,但檢測靈敏度沒有eb高。

gelred--號稱無毒,無**滲入型,有傷口就不好說了。背景螢光弱,但加多了容易出現拖帶。由於在市場上**較高,所以有出現很多仿冒貨,買時要擦亮眼睛。

瓊脂糖凝膠電泳操作應注意哪些環節

4樓:駒毅

1. 根據片段大小配製不同濃度的膠(改變解析度),片段越小,需要膠濃度越大。

2. 膠要現制先用。

3. 選擇合適的marker。

4. 配膠的緩衝液與電泳緩衝液要是同一種,且濃度一致(1倍)。

5. 點樣時要加入loading buffer,並注意,不要將樣點到點樣孔之外(飄樣),也不要將膠戳漏(漏樣)。

6. 根據片段大小,及電泳檢測目的,選擇合適的電壓及電泳時間。

7. eb染色。可選擇制膠時加入eb(要在溶玩膠後,且溫度至室溫時(用手握住制膠容器,不燙手即可));或電泳結束後,將膠放入eb溶液中染色。

瓊脂糖凝膠電泳的原理什麼

5樓:汪小東最懷薰

瓊脂糖凝膠具有網路結構,物質分子通過時會受到阻力,大分子物質在湧動時受到的阻力大,因此在凝膠電泳中,帶電顆粒的分離不僅取決於淨電荷的性質和數量,而且還取決於分子大小,這就大大提高了分辨能力。

但由於其孔徑相比於蛋白質太大,對大多數蛋白質來說其分子篩效應微不足道,現廣泛應用於核酸的研究中。

瓊脂糖凝膠電泳是用瓊脂糖作支援介質的一種電泳方法。其分析原理與其他支援物電泳最主要區別是:它兼有「分子篩」和「電泳」的雙重作用。

核酸是兩性電解質,其等電點為ph2-2.5,在常規的電泳緩衝液中(ph約8.5),核酸分子帶負電荷,在電場中向正極移動。

核酸分子在瓊脂糖凝膠中泳動時,具有電荷效應和分子篩效應,但主要為分子篩效應。

線狀雙鏈dna分子在一定濃度瓊脂糖凝膠中的遷移速率與dna分子量對數成反比,分子越大則所受阻力越大,也越難於在凝膠孔隙中移動,因而遷移得越慢。

電泳緩衝液的組成及其離子強度影響dna的電泳遷移率。在沒有離子存在時(如誤用蒸餾水配製凝膠),電導率最小,dna幾乎不移動;在高離子強度的緩衝液中(如誤加10×電泳緩衝液),則電導很高並明顯產熱,嚴重時會引起凝膠熔化或dna變性。

瓊脂糖凝膠具有網路結構,物質分子通過時會受到阻力,大分子物質在湧動時受到的阻力大,因此在凝膠電泳中,帶電顆粒的分離不僅取決於淨電荷的性質和數量,而且還取決於分子大小,這就大大提高了分辨能力。

蛋白質和核酸會根據ph不同帶有不同電荷,在電場中受力大小不同,因此跑的速度不同,根據這個原理可將其分開。

電泳緩衝液的ph在6~9之間,離子強度0.02~0.05為最適。

常用1%的瓊脂糖作為電泳支援物。瓊脂糖凝膠約可區分相差100bp的dn**段,其解析度雖比聚丙烯醯胺凝膠低,但它製備容易,分離範圍廣。

普通瓊脂糖凝膠分離dna的範圍為0.2-20kb,利用脈衝電泳,可分離高達10^7bp的 dn**段。

dna分子在瓊脂糖凝膠中泳動時有電荷效應和分子篩效應。dna分子在高於等電點的ph溶液中帶負電荷,在電場中向正極移動。

由於糖-磷酸骨架在結構上的重複性質,相同數量的雙鏈dna幾乎具有等量的淨電荷,因此它們能以同樣的速率向正極方向移動。

6樓:小凝聊娛樂

瓊脂糖凝膠電泳的原理:瓊脂糖凝膠電泳是常用的用於分離、鑑定dna、rna分子混合物的方法,這種電泳方法以瓊脂凝膠作為支援物,利用dna分子在泳動時的電荷效應和分子篩效應,達到分離混合物的目的。

dna分子在高於其等電點的溶液中帶負電,在電場中向陽極移動。在一定的電場強度下,dna分子的遷移速度取決於分子篩效應,即分子本身的大小和構型是主要的影響因素。dna分子的遷移速度與其相對分子量成反比。

不同構型的dna分子的遷移速度不同。如環形dna分子樣品,其中有三種構型的分子:共價閉合環狀的超螺旋分子(cccdna)、開環分子(ocdna)、和線形dna分子(idna)。

這三種不同構型分子進行電泳時的遷移速度大小順序為:cccdna>idna>ocdna

核酸分子是兩性解離分子,ph3.5是鹼基上的氨基解離,而三個磷酸基團中只有乙個磷酸解離,所以分子帶正電,在電場中向負極泳動;而 ph8.0-8.

3時,鹼基幾乎不解離,而磷酸基團解離,所以核酸分子帶負電,在電場中向正極泳動。

不同的核酸分子的電荷密度大致相同,因此對泳動速度影響不大。在中性或鹼性時,單鏈dna與等長的雙鏈dna的泳動率大致相同。

擴充套件資料

影響核酸分子泳動率的因素

1、樣品的物理性狀

即分子的大小、電荷數、顆粒形狀和空間構型。一般而言,電荷密度愈大,泳動率越大。但是不同核酸分子的電荷密度大致相同,所以對泳動率的影響不明顯。

對線形分子來說,分子量的常用對數與泳動率成反比,用此標準樣品電泳並測定其泳動率,然後進行dna分子長度(bp)的負對數——泳動距離作標準曲線圖,可以用於測定未知分子的長度大小。

dna分子的空間構型對泳動率的影響很大,比如質粒分子,泳動率的大小順序為:cdna>idna>ocdna但是由於瓊脂糖濃度、電場強度、離子強度和溴化乙錠等的影響,會出現相反的情況。

2、支援物介質

核酸電泳通常使用瓊脂糖凝膠和聚丙烯醯胺凝膠兩種介質,瓊脂糖是一種聚合鏈線性分子。含有不同濃度的瓊脂糖的凝膠構成的分子篩的網孔大小不同,是於分離不同濃度範圍的核酸分子。聚丙烯醯胺凝膠由丙烯醯胺(acr)在n,n,n′-四甲基乙四胺(temed)和過硫酸銨(ap)的催化下聚合形成長鏈,並通過交聯劑n,n′-亞甲雙丙烯醯胺(bis)交叉連線而成,其網孔的大小由acr與bis的相對比例決定。

瓊脂糖凝膠適合分離長度100至60的分子,而聚丙烯醯胺凝膠對於小片段(5bp-500bp)的分離效果最好。選擇不同濃度的凝膠,可以分離不同大小範圍的dna分子。

3、電場強度

電場強度愈大,帶點顆粒的泳動越快。但凝膠的有效分離範圍隨著電壓增大而減小,所以電泳時一般採用低電壓,不超過4v/cm。而對於大片段電泳,甚至用0.

5-1.0v/cm電泳過夜。進行高壓電泳時,只能使用聚丙烯醯胺凝膠。

4、緩衝液離子強度

核酸電泳常採用tae、 tbe、tpe三種緩衝系統,但它們各有利弊。tae**低廉,但緩衝能力低,必須進行兩極緩衝液的迴圈。tpe在進行dna**時,會使dna汙染磷酸鹽,影響後續反應。

所以多採用tbe緩衝液。

在緩衝液中加入edta,可以鰲合二價離子,抑制dnase,保護dna。

緩衝液ph常偏鹼性或中性,此時核酸分子帶負電,向正極移動。

核酸電泳中常用的染色劑是溴化乙錠(ethidium bromide eb)。溴化乙錠是一種扁平分子,可以嵌入核酸雙鏈的配對鹼基之間。在紫外線照射be-dna複合物時,出現不同的效應。

254nm的紫外線照射時,靈敏度最高,但對dna損傷嚴重;360nm紫外線照射時,雖然靈敏度較低,但對dna損傷小,所以適合對dna樣品的觀察和**等操作。300nm紫外線照射的靈敏度較高,且對dna損傷不是很大,所以也比較適用。

使用溴化乙錠對dna樣品進行染色,可以在凝膠中加入終濃度為0.5μg/ml的eb。eb摻入dna分子中,可以在電泳過程中隨時觀察核酸的遷移情況,但是如果要測定核酸分子大小時,不宜使用以上方法,而是應該在電泳結束後,把凝膠浸泡在含0.

5μg/mleb的溶液中10~30min進行染色。be見光分解,應在避光條件下4℃儲存。

7樓:匿名使用者

瓊脂糖凝膠電泳是用瓊脂糖作支援介質的一種電泳方法。其分析原理與其他支援物電泳的最主要區別是:它兼有「分子篩」和「電泳」的雙重作用。

瓊脂糖凝膠具有網路結構,物質分子通過時會受到阻力,大分子物質在湧動時受到的阻力大,因此在凝膠電泳中,帶電顆粒的分離不僅取決於淨電荷的性質和數量,而且還取決於分子大小,這就大大提高了分辨能力。但由於其孔徑相當大,對大多數蛋白質來說其分子篩效應微不足道,現廣泛應用於核酸的研究中。

dna分子在瓊脂糖凝膠中泳動時有電荷效應和分子篩效應。dna分子在高於等電點的ph溶液中帶負電荷,在電場中向正極移動。由於糖-磷酸骨架在結構上的重複性質,相同數量的雙鏈dna幾乎具有等量的淨電荷,因此它們能以同樣的速率向正極方向移動。

瓊脂糖凝膠電泳有哪些優點?

8樓:匿名使用者

(bai 1 )瓊脂糖凝膠結構均勻,du含水量大(約佔zhi 98 %~ 99 %),近似自dao由電泳,樣內品擴散度較自由電泳小,對樣容品吸收吸附極微,因此電泳圖譜清晰,解析度高,重複性好。

( 2 )瓊脂糖呈透明狀,無紫外吸收,電泳後的樣品可直接用紫外檢測;電泳後區帶易染色,樣品易洗脫,便於定量測定。

( 3 )操作簡單,電泳速度快,樣品不需事先處理就可進行電泳。

9樓:

生物化學實驗書上有詳細的說明。

瓊脂糖凝膠電泳marker的作用

瓊脂糖凝膠電泳marker的作用是分子標記。dna分子標記具有的優越性有 大多數分子標記為共顯性,對隱性性狀的選擇十分便利 基因組變異極其豐富,分子標記的數量幾乎是無限的 在生物發育的不同階段,不同組織的dna都可用於標記分析 分子標記揭示來自dna的變異 表現為中性,不影響目標性狀的表達,與不良性...

瓊脂糖凝膠電泳具體操作步驟是什麼?需要注意什麼事項

一 操作步驟 1 電泳方法 一般的核酸檢測只需要瓊脂糖凝膠電泳就可以 如果需要解析度高的電泳,特別是只有幾個bp的差別應該選擇聚丙烯醯胺凝膠電泳 用普通電泳不合適的巨大dna鏈應該使用脈衝凝膠電泳。2 凝膠濃度 對於瓊脂糖凝膠電泳,濃度通常在0.5 2 之間,低濃度的用來進行大片段核酸的電泳,高濃度...

瓊脂糖和瓊脂有什麼不同,瓊脂與卡拉膠有什麼區別 各自有什麼用途 請詳盡解釋說明,重酬

一 熔化溫度不同 1 瓊脂糖 在水中一般加熱到90 以上溶解。2 瓊脂 在水中需加熱至95 時才開始熔化。二 主要原料不同 1 瓊脂糖 於紅藻。2 瓊脂 石花菜,江籬等紅藻。三 包含不同 1 瓊脂糖 瓊脂糖是線性的多聚物,是組成瓊脂的一部分。2 瓊脂 瓊脂是由瓊脂糖和瓊脂果膠組成的。四 應用不同 1...