為什麼提取植物全基因組DNA總是降解

時間 2023-01-16 05:45:09

1樓:道峰山營

降解無怪乎幾種原因:

1,加入提取液後,若是65度提取,時間太久,有可能造成部分降解。

2,降入氯仿/異戊醇後,劇烈混勻時間太久,造成部分dna斷裂3,打碎組織時最好用液氮處理後研磨的方式,用珠子打碎在後期混勻過程中也容易造成dna斷裂。

簡述ctab法提取植物基因組總dna的原理

2樓:蒯爍

1)取材料,加液氮研磨成粉末狀,迅速移入 ml eppendorf管中;

(2)加入800 μl的ctab提取緩衝液,混勻(ctab在65℃水浴預熱),每5min輕輕**幾次,20min後12000 r/min,離心15 min;

(3)小心吸取上清液,加入等體積的酚:氯仿(各400μl)溶液,混勻,4℃,12000 r/min,離心10 min;

(4)小心吸取上清液,加入等體積的氯仿,混勻,4℃,12000 r/min,離心10 min。

(5)重複步驟(4)1-2次,以蛋白層不出現為止;

(6)取上清,-20℃沉澱1h,4℃,12000 r/min,離心10 min;

(7)棄去上清液,用70%乙醇洗滌沉澱2次;

(8)室溫下乾燥後(一般乾燥5-15 min),溶於30-50 μl depc去離子水中,於-20℃或者-70℃下儲存備用。

3樓:夜楣

首先,你先確定你用ctab法提取植物基因組的dna是否提取出來,你的膠上dna的亮度如何?

如果肯定你的dna沒有問題的話,是不是你的引物有問題?之前有用過同種引物嗎?引物的退火溫。

度是否正確?pcr出不來,是有很多原因的,不是單純的dna的問題。

你先瓊脂糖檢測dna是否有問題?如果dna沒有問題的話,再去看你引物的問題,是不是合適的引物?

如果引物也是對的,再看一下退火溫度。

4樓:網友

ctab法原理 ctab(hexadecyltrimethylammonium

bromide,十六烷基三甲基溴化銨),是一種陽離子去汙劑,具有從低離子強度溶液中沉澱核酸與酸性多聚糖的特性。在高離子強度的溶液中(> nacl),ctab與蛋白質和多聚糖形成複合物,只是不能沉澱核酸。

通過有機溶劑抽提,去除蛋白,多醣,酚類等雜質後加入乙醇沉澱即可使核酸分離出來。

植物基因組提取dna實驗為什麼得到的沉澱偏少?

5樓:網友

因為沉澱是dna或者rna等少量物質,沉澱少說明植物的細胞壁還沒弄破,或者基因組和提取液沒有混合好。

我為什麼最近提取真菌的基因組dna總是提取不出

6樓:昊鑫生物

真菌用溶菌酶沒有,應該是用液氮或者石音沙研磨破壁。

劑盒採用dna吸附柱和新型獨特的溶液系統,適合於從真菌組織細胞中快速簡單地提取基因組dna。可在30分鐘內完成乙個或多個100mg新鮮或20mg乾燥的真菌樣品dna的純化工作。提取過程不需要用到有毒的酚氯仿等有機物抽提,也不需要用到耗時的異丙醇或乙醇沉澱,並能快速高效地去除多醣類、酚類和酶抑制物等雜質,純化的dna可直接用於pcr、酶切和雜交等實驗。

新鮮或乾燥的真菌組織(細胞)磨碎後經裂解液裂解;蛋白質、多醣、細胞殘片被沉澱去除;然後基因組dna在高離序鹽狀態下選擇性吸附於離心柱內矽基質膜, 再通過一系列快速的漂洗-離心的步驟, 進一步將多醣,多酚和細胞代謝物,蛋白等雜質去除, 最後低鹽的洗脫緩衝液將純淨基因組dna從矽基質膜上洗脫。

特點:1.離心吸附柱內矽基質膜全部採用進口特製吸附膜,柱與柱之間吸附量差異極小,可重複性好。克服了國產試劑盒膜質量不穩定的弊端。

2.不需要使用有毒的苯酚等試劑,也不需要乙醇沉澱等步驟。

3.快速,簡捷,單個樣品操作一般可在1小時內完成。

4.數種去多醣、多酚成份和多次柱漂洗確保高純度,od260/od280典型的比值達,可直接用於pcr,southern-blot和各種酶切反應。

pcr植物基因組dna,為什麼就一直p不出來捏

7樓:匿名使用者

檢查以下問題:

tag酶是否有問題。

引物設計是否有問題。

基因組dna提取是否有問題。

退火溫度是否太高。

如果別人能p出來你p不出來,引物就沒問題,如果從來沒p出來過,重新設計引物,注意cg含量。

植物基因組dna提取跑膠條帶很寬,是為什麼

8樓:包遐思佟黛

不在同一直線就對了,因為基因組dna都很大,提前過程中難免會被打斷而形成大小不同片段,所以,不同時間提前的同一樣品的基因組dna也不可能完全一樣,會產生不同的條帶。

求生物高手指點,做dna、rna提取實驗時提取的基因組dna有降解,如何解決? 5

9樓:阿伊宴曉

在實驗過程中注意加入edta,因為它是dna的酶抑制劑,dna在變性後,可以防止dna被降解。在加入鹼性溶液破碎細胞後,搖動離心管一定要溫和,不能振盪,盡可能上下顛倒混。並且要注意時間間隔做下一步不要太長,這時候也可能破壞了dna,使其降解,所以一定要把握好時間。

10樓:洛瀾漪

提取的是什麼的dna啊,動物植物還是細菌。實驗過程小心dna酶的汙染,edta注意不能過期,如果可以的話盡量採用液氮研磨提取,如果沒有液氮也要保持低溫,沉澱重懸的時候動作一定要注意輕柔,否則也會破壞dna的完整性,儘量減少蛋白質的汙染,否則會影響dna的進一步操作的。個人提取dna時候的一點經驗,希望對你有幫助。

11樓:網友

不要暴露在空氣中太長時間,dna rna 的提取不要同時進行 因為提取rna的時候用到了dna酶。

提取植物基因組dna是,用無水乙醇沉澱、離心後管底有褐色沉澱。這是怎麼回事啊?請問有什麼方法可以避免

12樓:匿名使用者

正常現象,這是由於在氯仿異戊醇(或苯酚)抽提過程中植物色素等雜質沒有完全抽提乾淨,可以由以下幾個措施避免:

一、用專用的植物dna提取試劑盒,雜質會比較少一點;

二、盡量使用幼嫩的植物組織提取,減少樣品中色素含量;

三、用氯仿異戊醇多抽提幾次,將色素蛋白多醣等雜質萃取乾淨;

四、加乙醇冷凍沉澱後不要離心,用槍頭挑出其中的絮狀dna,可以減少雜質殘留。話說有褐色其實影響也不大,做普通的pcr還是能用的。

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