為什麼構建載體,酶切成功但測序結果紊亂

時間 2023-01-14 17:55:06

1樓:龍鳳油洺月

測序結果紊亂,你這個描述不具體啊。是測序完全失敗,重複序列後雙峰,訊號衰減,或者別的情況啊。

2樓:來自荷園星眸微嗔的豌豆

您這個問題最後解決了嗎?請問是怎麼解決的。

構建質粒時,經酶切鑑定片段已經連上了,但是拿去測序總是不准。

3樓:網友

測序一般900~1000以後就不准了,不可信,你看下峰圖就知道了,都亂的。測序只要告訴測序公司測通即可,他們會設計解決這問題的,並幫你拼接好結果發過來,太長大不了測3個麼,不用你自己在那兒搗鼓。

4樓:匿名使用者

質粒本身有沒有問題?測序時讀到質粒序列嗎?

5樓:網友

中間有進行pcr嗎?你每乙個轉殖每乙個方向測了幾個反應,你能確定那些突變時測序錯誤的還是真的有突變嗎?

自己設計的基因匯入到載體後,擴增完成,用pcr檢測和雙酶切檢測成功,但是測序後基因配對率不高,求指教

6樓:匿名使用者

pcr檢測和酶切檢測成功的話,說明你確實插入東西了,你確定你這兩種檢測用的引物和酶都沒問題嗎?測序結果你是用正向引物測序的還是用的反向引物測序的,如果是反向引物的話,測序結果需要reverse complement以後再跟原始序列進行比較。

7樓:匿名使用者

你再比下測序結果的互補序列、反向序列、反向互補序列看看,是否是忘了這麼比較了。

如果再不是的話那就說明你的這段序列不是保守序列。

你好,我想問問為什麼菌落pcr能鑑定出來,酶切也能切出來,但測序結果為什麼比對不上

8樓:廣鴻勤先本

酶切鑑定需要培養大腸桿菌,抽提質粒後才能進行。缺點是耗時,優點是結果可靠。菌落pcr只需用接種針或小槍頭蘸一下菌落或菌液,再接入pcr體系中,通過pcr即可判斷目標條帶的存在。

優點是獲得結果快,缺點是可能有假陽性。

t 載體與 目的基因連線成功,測序結果也正確。從新搖菌,提取質粒,在進行雙酶切,一直切不下來。

9樓:匿名使用者

解決辦法:bai1、cla1是乙個比較不常見的酶,du可能酶切體系和。

zhiecor1的緩衝dao體系不一樣,試著分別回酶切,就是先切cla1,然答後純化後切ecor1;或者查詢哪個酶的酶切效率高些,那個後切;2、3個小時可能太短了,我一般都是5個小時,或者過夜;3、可能是你菌挑錯了,或汙染了,重新調菌或者把原來構建成功的質粒進行轉化,再酶切。希望對你有幫助。

10樓:郭海強

可能是你酶的問題哦,加入酶失活了,切乙個星期都沒用,建議換另外實驗室的試一下。

11樓:匿名使用者

你的引物含有claⅰ的酶切位點嗎?用載體上的其他酶切位點,雙酶切鑑定下看看。也許酶有問題。

質粒pcr結果很好,為什麼酶切卻做不出來

12樓:完玉花薛珍

pcr非常靈敏,你做連線的時候連線產物就是目的片段和載體,轉化的時候連線產物混到感受態細胞裡,塗板的時候,那些沒連線進去的目的片段dna則存在於你的平板上,菌落上自然也有,而挑菌落的時候則把把這些dna帶到了試管或者三角瓶裡,提質粒的時候它們因為很短,自然不會被蛋白質細胞器基因組dna沉澱帶走,最後和陰性質粒一起再接受pcr,所以出了假陽性。

這也是為什麼菌落pcr的假陽性遠遠高於菌液pcr的原因,一般菌液pcr不容易遇到假陽性的,尤其做了藍白篩選或者用了帶有致死基因的轉殖載體,不過送去測序之前都最好經過酶切確認。

13樓:虢景明昝儀

既然你的質粒已經提出來了,那麼感受態、轉化等因素就不必再考慮了。

你看看雙酶切後載體的位置有幾條帶,如果是兩條,那說明酶切不完全,如果是一條,那說明酶切效率沒問題。

pet28a分子量為,你的插入片段為500bp,如果你的質粒完全切開,載體和插入片段的摩爾比為1:1,質量比就是5.

6k:,跑膠後兩條帶的亮度比就是10:

1,所以你目的條帶很淡非常正常。

換句話說,你的實驗一切正常,那條500bp的條帶可能本來就應該那麼淡。

近期在質粒構建是pcr和酶切後都有目的條帶,但是就是連線轉化後沒有點,或者有點但是是陰性的,哪有問題

14樓:匿名使用者

都有可能。

你可以多做幾個對照,如空載體轉化、空細胞塗板等等,幫助縮問題小範圍你可以詢問實驗室其他人員,看看酶是否有問題,感受態是否有問題,抗生素是否有問題,等等。

按你給的線索,菌落很少,很有可能是切開的線性質粒沒有連上片段,轉不進細胞,少量沒有切開的空載體轉進細胞,形成陰性菌落。問題可能在片段酶切上,建議連t載體再切,或雙酶切換成兩步單酶切,或換酶切位點,或重新設計保護鹼基。

15樓:網友

連t載體拿去測序 看p出來的是不是你要的條帶 要麼就是質粒酶切的之後**的不好 最好在旁邊跑一道沒有切的質粒 這樣能看出來哪條帶是切開的質粒。

我的3個質粒測序結果都正確,但是做雙酶切結果只有乙個能切下來dn**段,為什麼呢?

16樓:匿名使用者

你重組質粒的宿主菌是一樣的嗎,如果宿主菌是bl21,那麼提取的質粒是不能直接酶切的。需要**質粒後才能被酶切開。。

17樓:不如水昔

這個可能性太多了吧。

這個不好說啊。你得乙個條件乙個條件的排除。

干擾載體小抽酶切和測序都正確 但是大抽酶切不對 為什麼

18樓:活寶冰雨夢悠悠

為什麼可以用不同的限制酶來切目的基因和載體? -我們首先要明白酶切的目的是什麼!其實就是把質粒切開乙個缺口,好讓目的基因進入!

而採用不同限制酶的原因是:載體上可用到的位點較少,確定載體需要的位點之後,再觀察目的基因,但是載。

在基因表達構建載體中什麼切割質粒什麼切割目的基因,為什麼

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